农业银行的金穗借记卡会扣年费，年费为10元。但是如果账户内的日均存款不足300元，则按照每个季度收取3元的规定，折合下来每年需要收取的管理年费为12元。通常情况下，农行借记卡年费是在开卡后的第二个月收取。