创新基金根据中小企业和项目的不同特点，创新基金分别以贷款贴息、无偿资助、投资补助等不同的方式给予支持。一般按贷款额年利息的50%到100%给予补贴，贴息总额一般不超过100万元，个别重大项目最高不超过200万元。

创新基金面向的是在中国境内注册的各类中小企业，其支持的项目应该符合国家产业技术政策、有较高创新水平和较强市场竞争力、有较好的潜在经济效益和社会效益、有望形成新兴产业的高新技术企业，具有健全的财务管理制度。