公寓商业贷款是否可以取公积金还款主要取决于公寓的性质，具体如下：

1、如果相关用户的公寓产权是40年的期限，那么是属于商业用地，这种情况下是不可以提取公积金的账户余额进行还贷的。

2、如果相关用户的公寓产权是70年的期限，那么是属于住宅用地，那么是可以提取公积金还款的。

具体可以咨询一下当地的公积金管理中心，因为各地的政策是有所不同的。