房产抵押贷款不能用公积金余额还款。

公积金通常只可以用来冲抵购房贷款，不可以用来还房产抵押贷款。用户如果想还房屋抵押贷款的贷款，那么只可以用自己的资金来进行还款。

购房贷款与房产抵押贷款是不一样的，不一样的地方在于，购房贷款是借款人申请贷款资金用来买房，支付了首付款以后的剩下的房款；房产抵押贷款指的是用房产抵押得到的贷款资金用于生活消费或者生产经营。