虽然组合贷款涉及到银行和公积金管理中心两个机构，但如果打算提前还款，先偿还商业贷款部分还是公积金贷款部分，申请人是可以自由选择的。

组合贷款的申请：

1.申请组合贷款，初审手续与公积金贷款相同；

2.初审通过后，借款人到银行办理公积金贷款其它手续时，要按照银行要求填写商业贷款部分的借款申请表并办理有关手续；

3.两部分贷款审批完成后，同时由银行拨付到售房单位帐户；

在组合贷款中，公积金贷款和商业贷款的贷款期限、借款日期和还款日期都是相同的，只不过执行不同的利率。